該成果是一組計算機軟件套件。由不具同源關(guān)系的氨基酸序列預測蛋白質(zhì)的三維結構是計算生物學(xué)領(lǐng)域中的挑戰之一。本系統應用一種基于共享信息素的并行蟻群優(yōu)化算法(圖1),在現有能量函數指導下，通過(guò)不同能量項之間的相互制約， 構建具有最低能量的蛋白質(zhì)骨架結構。具 有了蛋白質(zhì)結構的計算機預測能力后，該 系統無(wú)縫整合了蛋白質(zhì)對接系統(圖2), 能夠實(shí)現蛋白質(zhì)一蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)一配 體和蛋白質(zhì)一肽段的計算機對接，為新藥發(fā)現提供硅片(in silicon)上的干實(shí)驗室 (dry lab)結果。以上成果獲得中國國家 自然科學(xué)基金委的多次項目資助。
